1911年７月，宋教仁与谭人凤、陈其美在上海组建同盟会中部总会，亲任总务干事。他亲自来往于上海、两湖各地，积极发展中部总会分会，筹款购买武器弹药，推动长江中下游流域的革命进程。武昌起义成功后，宋教仁对军政首脑大权旁落深为警惕，他试图策动黄兴为湖南湖北大都督，未成功，又转而从地方政权建设入手，起草《鄂州约法》，经审定，随即由军政府颁布。这是中国历史上第一部共和制宪法性质文件，体现了近代西方民主精神。南京临时政府成立，宋教仁被任命为法制院院长。他很快就起草了一部宪法草案《中华民国临时政府组织法》，仍然主张内阁制，并被孙中山所接受。以后出台的《临时约法》，就是以宋教仁的《鄂州约法》和该宪法草案为蓝本的。

  宋教仁将组织政党视为民主共和的头等大事。他计划以同盟会为基础，将其改组为一个带有建设性质的、有制衡作用的议会型政党，以“从事于宪法国会之运动，立于代表国民监督政治之地位”。在他积极而艰苦的努力下，终于促成了同盟会与当时其他党派所谓的联合，形成了一个颇具声势的新党——国民党。1912年8月25日，国民党在北京召开会议，正式宣告成立。孙中山虽被推选为国民党理事长，但他委托宋教仁代理，因此，实际上是宋教仁一手领导国民党。

  宋教仁的这些活动对袁世凯的独裁统治带来极大的威胁。袁世凯在与杨度的一次谈话中说，无论孙中山还是黄兴都好对付，“顶难驾驭的，只有一个宋教仁”。为实现自己的权力野心，袁世凯也曾设法对宋教仁进行收买。他先是许愿，要让宋教仁当总理，孰料“不恋权位，只重政见”的宋教仁坚辞不就。封官许愿不成，袁世凯又施以物质金钱腐蚀，特地召见宋教仁，赠送价值3000元的貂皮外套一件，后又托人赠以高达50万元可随意支取的存折一份。对此，宋教仁表现得光明磊落，全部退回不受。“敬酒”不吃，袁世凯准备拿出“罚酒”。

  国会议员选举结果揭晓，国民党初选告捷，取得了参众两院总议席870席中的392席，得票率高达45%。国民党在中国历史上属于第一次真正的国会选举中大获全胜。这一结果使宋教仁大受鼓舞，踌躇满志的他准备筹划组织第一届责任内阁，以国民党代理党魁身份，宋成为责任内阁的阁揆已经是顺理成章的事。这势必造成与袁世凯分庭抗礼的局面。袁世凯动手了。

  1913年3月20日晚10点，宋教仁自上海乘火车赴北京。正当宋走至车站入口的检票处，伸手去取收票员检过的车票时，突然一声枪响，子弹击中他的腰部并进入腹腔。送行的黄兴、于右任等人赶紧扶住他，一面派人报警，一面紧急送入附近的沪宁铁路医院急救。在医院里，医生用钳子从他的小腹取出子弹，发现子弹有毒，虽然流血不多，但是致命。3月22日清晨，宋病势恶化，无法挽救，与世长辞。这时他只有33岁。